Булгаков мастерски использует фантастический сюжет для глубоких философских обобщений. История Шарикова становится аллегорией революционных преобразований в России. Автор показывает, как попытка искусственно создать "нового человека" приводит к катастрофическим последствиям. Шариков, унаследовавший черты своего донора — уголовника и алкоголика Клима Чугункина, быстро усваивает худшие черты новой эпохи: хамство, агрессию, доносительство.
Центральный конфликт повести — столкновение двух миров: интеллигенции в лице профессора Преображенского и "нового общества" в лице Шарикова и председателя домкома Швондера. Булгаков с горькой иронией показывает, как разрушаются вековые культурные ценности, уступая место грубой силе и примитивным инстинктам. Особенно показательны сцены, где Шариков, едва научившись читать, требует себе "пайку" и пишет донос на своего создателя.
Важную роль в повести играет образ Москвы 1920-х годов. Булгаков рисует мрачную картину города, где царит разруха, а новые хозяева жизни демонстрируют полную неспособность к созидательной деятельности. Квартира Преображенского становится последним оплотом порядка и культуры в этом хаосе.
Финал повести глубоко символичен. 
"Собачье сердце" остается актуальным и сегодня, заставляя задуматься о пределах научного вмешательства в природу человека, о ценности культуры и образования, о последствиях революционных преобразований. Булгаковская сатира, сочетающая гротеск и глубокий психологизм, создает универсальную картину общества, стоящего на грани между цивилизацией и хаосом.